Le musée régional de Natitingou est un musée béninois localisé dans la ville de Natitingou, dans le département d’Atacora. L’historique de ce musée a commencé par celle du bâtiment. C’est un bâtiment colonial construit par les colons en 1915 et qui servait à l’époque, de Bureau au Commandant de cercle et son logement. Après les indépendances en 1960, le bâtiment a abrité la Préfecture de l’Atacora jusqu’en 1987 avant que la Préfecture ne dégage les lieux pour ses nouveaux locaux.